Vagnerova ist allgemein auf geriatrische Ernährung spezialisiert, insbesondere auf Ernährungsfragen bei Sarkopenie, geriatrischer Gebrechlichkeit, Palliativmedizin, Kachexie und Wundheilung. Sie arbeitet auch auf einer Schlaganfallstation (ICU), in der Neurologie und in der Rehabilitationsabteilung nach Schlaganfall mit, die eng mit der Geriatrie verbunden sind.

Seit 2019 ist Vagnerova Assistenzprofessorin an der Geriatrischen Klinik in Prag und hält Vorlesungen über klinische Ernährung an der Charles University First Faculty of Medicine. Vagnerova ist außerdem Mitglied des Exekutivausschusses des tschechischen Verbands der Diätassistenten.